In Phantasy Star Zero c’ è un’ unica lobby, la città di Dairon, e otto diversi stage. Ognuno dei primi 7 stage è diviso in due blocchi, distinti fra loro da lievi differenze nello scenario. All’ inizio dello stage c’ è un’ area introduttiva predefinita, dove un dialogo o una scena iniziale introducono la missione. I blocchi in sè sono invece principalmente costituiti da aree generate in modo casuale. Fra i due blocchi c’ è una zona intermedia, anche questa predefinita, che funge da area di passaggio fra i due diversi ambienti, dove si affronterà un mini-boss o dove saranno inseriti dialoghi o cut-scenes relative alla trama. Al termine dei due blocchi, dopo una breve scena o un breve dialogo, si accederà all’ area finale, dove si affronterà il boss di fine stage.
L’ ultimo e ottavo stage invece, Eternal Tower, è composto da 101 piani… ed è necessario completarlo per poter accedere al successivo livello di difficoltà.
Dairon City
Dairon City è una città pacifica che ospita numerosi mercanti ed esploratori. E’ il centro delle avventure di PSZ, dove è possibile comprare e vendere armi, armature e item, depositare in banca il proprio denaro e usufruire dei servizi della Hunter’s Guild, da cui riceverai il visto per accedere alle missioni del gioco.
 | Vendere e comprare armi: Da questo personaggio si potranno comprare e vendere le armi e gli item di difesa. La prima opzione in alto indica: COMPRARE. Accedendovi verranno visualizzate tre possibilità di scelta: ARMI, ARMATURE, UNIT. La seconda opzione invece indica: VENDERE. I prodotti in vendita verranno aggiornati con item di maggior valore ad ogni missione conclusa. |
 | Vendere e comprare item: Da questo personaggio si potranno invece comprare e vendere i cosidetti item “consumabili”, come monomate, monofluid, etc. Item destinati a ripristinare HP, PP o modificare in maniera permanente o temporanea determinate statistiche del personaggio. La prima opzione in alto indica: COMPRARE. I prodotti in vendita verranno aggiornati con item di maggior valore ad ogni missione conclusa. |
 | Accesso alle quest: Parlando con questa signorina si potrà accedere a qualsiasi missione. La prima opzione in alto significa: “Scendi in campo”, per mezzo della quale si avrà accesso a delle missioni dove vi sarà un bonus nel drop-rate ma nessuna “reward”. La seconda opzione è “Seleziona quest”. Completando una di queste missioni si guadagneranno EXP e una “reward”. Da qui si potrà accedere a “Main-Quest” e “Sub-Quest”. Completando una Main-Quest, si avanzerà nella storia e si sbloccheranno altre Sub-Quest. Giocando in wi-fi mode, si potranno selezionare quest cooperative. |
 | Personal Counter: Da qui si possono gestire i propri item. Box: Depositare Item – Ritirare Item – Depositare Meseta – Ritirare Meseta Common Box: per scambiare item con gli altri personaggi. Item Trade: per scambiare item con altri giocatori. Record: - sommario dei punteggi del proprio personaggio. - lista delle quest completate. - nemici incontrati e quante volte li si è sconfitti. - tutte le armi ottenute nel gioco suddivise per tipologia. - classifica dei record del giocatore e dei suoi amici. - tutti i titoli ottenuti. - ricompense dei titoli ottenuti. |
 | Custom Shop: Nei Custom Shop si potrà modificare il proprio equipaggiamento, sia potenziando l’ attributo elementare delle proprie armi sia effettuare una “sintesi elementare”. La “sintesi elementare” consente di applicare un elemento ad un’ arma, usando i “cristalli elementari”. Il potenziamento dell’ attributo elementale si potrà applicare sia alle armi sia alle armature. |
Photon & Enemy Collector Shop
I Photon Collector sono negozi clandestini segreti dove si potranno scambiare Photon Drop con armi o altri item. Mentre gli Enemy Collector sono negozi clandestini segreti realizzano armi dalle parti del corpo dei nemici.
Gurhacia Valley
Gurhacia Valley è una valle situata in un canyon desertico. Il Great Blank non ha lasciato grosse conseguenze sulla vegetazione e sulla fauna di quest’ area. Il primo blocco è collocato sulla base del canyon fra sentieri polverosi, scarsa vegetazione e piccoli laghetti piovani. Il secondo blocco è invece sulla cima del canyon, dove pericolanti ponti di legno conducono da un lato all’ altro dell’ altipiano. A presiedere il canyon vi è un ferocissimo dragone.
Ozette Wetland
Ozette Wetlands è una palude acquitrinosa, piena di vegetazione, insetti e un’ elevatissima umidità. Un’ area fino a poco tempo fa mai esplorata e che oggi viene scoperta giorno dopo giorno dagli Hunter. Nel primo blocco piove costantemente. Nel secondo un timido arcobaleno fa la sua comparsa fra fitte nuvole. In queste paludi alberga un gigantesco e viscido mostro tentacolare.
Rioh Snowfield
Rioh Snowfield è una zona innevata, situata su altipiani molto elevati. Nel primo blocco si combatterà in un bosco, la cui strada che lo attraversa è illuminata dalla flebile luce di lampioni in ferro battuto. Nella seconda parte invece lo scenario sarà quello di corsi d’ acqua ghiacciati e fredde caverne dal colore azzurro. Grossi scimmioni delle nevi proteggono questi territori dalle intrusioni esterne.
Oblivion City Paru è uno stage apparentemente lussureggiante e rigoglioso, che però cela in realtà le rovine di una metropoli dell’ evoluta civiltà tecnologica precedente. Nel primo blocco piante e muffe hanno ricoperto il terreno e le immense colonne decadute che sovrastano lo scenario. Nel secondo blocco si combatterà attraverso i resti di sopraelevate stradali ormai in abbandono (lo scenario è quello della Terra a 200 anni da una terribile catastrofe). I boss di questo stage sono due robot.
Le Makara Ruins sono le rovine di un antico sito costruito durante la civiltà precedente. A fare da scenario alla battaglia ci sono colonne monumentali, statue di pietra e costruzioni in decadenza. Nel primo blocco si esplorerà il sottosuolo delle rovine. Sullo sfondo laghetti sotterranei con enormi cristalli azzurri che emergono dall’ acqua e dalle rocce.
Arca Plant è un’ installazione residenziale situata sulla Luna. Il primo blocco è all’ interno di una raffinata area pubblica, dove evidentemente gli abitanti della colonia spaziale trascorrevano la loro vita e intraprendevano le loro reciproche relazioni sociali. Il secondo blocco è invece ambientato all’ interno del centro di controllo dell’ Arca Plant, dove sono computer e macchinari a fare da scenario.
Il Dark Shrine è il monumentale santuario dove risiedono un’ oscura divinità e i suoi servi. Il primo blocco, che è ambientato nelle sale di un plumbeo castello, è gremito di bianchi mostri dalla forma indefinita. Fra il primo e il secondo blocco, c’ è un passaggio all’ aperto, sulla cima del castello. Nel secondo blocco si accede invece ad un’ area residenziale del castello, dove lo scenario diventa luminoso e maestoso. Il secondo blocco al contrario del primo è popolato solo da mostri di colore nero.
L’ Eternal Tower è in realtà un grattacielo iper-tecnologico di 101 piani, costruito durante la precedente civiltà, situato all’ interno dell’ area di Oblivion City Paru. Qui si possono incontrare tutti i nemici incontrati negli stage precedenti. Completare l’ Eternal Tower è essenziale per sbloccare il Very Hard Mode.
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Piccolo
Laguna Loire